SMP 4 Pakem dan SMP Labschool merupakan dua sekolah yang mempunyai beberapa kesamaan. SMP 4 Pakem awalnya adalah sekolah yang bernaung di bawah IKIP Yogyakarta, sedangkan SMP Labschool bernaung di bawah yayasan UNJ dulu IKIP Jakarta. Kegiatan pendidikan pada dua sekolah tersebut sejak awal terus fokus pada karakter. Sebelum ada program penguatan pendidikan karakter (PPK) yang dilaunching oleh pemerintah, dua sekolah ini menyajikan implementasi penumbuhan budi pakerti-implementasi pendidikan karakter sebagai masukan masukan kepada kementrian Pendidikan dan Kebudayaan yang selanjutnya terlahir PPK yang merupakan program nasional. Dinilai sudah mengimplementasikan, dua sekolah tersebut sekaligus dijadikan piloting PPK.
Dalam rangka pelaksanaan PPK, dua sekolah ini telah membuat nota kesepahaman beberapa tahun lalu. Salah satu kegiatan bersama berbentuk pertukaran pelajar. Sejak ditandatangani nota kesepahaman oleh dua kepala sekolah yang dicomblangi Kementrian Pendidikan dan Kebudayaan, telah dilaksanakan pertukaran pelajar sebanyak 4 kali. Periode I, II, dan III siswa siswi SMP Labschool berada di SMP N 4 Pakem. Sedangkan periode IV siswa-siswi SMP N 4 Pakem berada di SMP Labschool.
Pertukaran pelajar tahap IV ini dari perencanaan, pembiayaan, dan segala sesuatunya dikelola oleh orang tua siswa. Kegiatan ini tentu dengan komunikasi yang intensif baik baik sesama orang tua SMP 4 Pakem maupun antara orang tua SMP 4 Pakem dengan orang tua siswa SMP labshool.
Pertukaran pelajar ini berlangsung tanggal 19 s.d. 24 Agustus 2019. Para orang tua bersepakat untuk trasportasi pulang pergi dengan pesawat. Kegiatan ini diikuti oleh 8 siswa kelas 9 didampingi satu guru yaitu ibu Kurnia Astiani. Sampai di sekolah disambut dengan sangat hangat oleh kepala sekolah Ibu Yati, Wakil kepala sekolah bapak Armat, Ibu Yuliana dan bapak Cep andi beserta buddy dari SMP Labschool Kebayoran. Setelah secara resmi di terima di sekolah tujuan, para siswa mengikuti semua kegiatan sekolah tersebut. Sore hari langsung pulang bersama para buddy-nya masing masing. Selanjutnya selama satu minggu siswa siswi bersekolah bersama sama siswa siswi asli SMP Labschool. Demikian pula mereka pulang dan tinggal ke rumah keluarga siswa-siswi SMP Labschool.
Kegiatan pertukaran pelajar sangat bermanfaat untuk meningkatkan pengetahuan, meningkatkan wawasan, memperkuat karakter kemandirian, nasionalis, gotong royong, integritas, serta karakter karakter lainnya. Selain pertrukaran pelajar sesama sekolah di Indonesia ini SMP 4 Pakem tiap tahun juga melaksakan pertukaran pelajar dengan sekolah sekolah di luar negeri lintas negara.
